Program Doktor Ilmu Ekonomi Konsentrasi Akuntansi berdiri sejak tahun 2010 dengan Surat Keputusan No. 02 /OT/1.01/KPTS/FE/III/2010. PDIE Konsentrasi Akuntansi berada di bawah naungan program Doktor Ilmu Ekonomi Fakultas Ekonomi dan Bisnis Universitas Trisakti. Pertama kali berdiri PÔDIE Konsentrasi Akuntansi diketuai oleh Alm Bpk. Prof. Dr. Itjang D. Gunawan, Ak.,MBA. Sepeninggalan Alm Bpk. Prof. Dr. Itjang D. Gunawan, Ak.,MBA digantikan oleh Ibu Prof. Dr. Etty Murwaningsari, AK.,MM.,CA sampai dengan sekarang.

Saat ini PDIE Konsentrasi Akuntansi memiliki mahasiswa aktif kurang lebih 123 mahasiswa dan 122 alumni. Mahasiswanya berasal dari para akademisi dan juga praktisi dari berbagai penjuru tanah air.

Seiring dengan keberadaannya, Program Studi Doktor Ilmu Ekonomi telah dievaluasi dan dinilai oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) untuk pertama kalinya dan mendapat Akreditasi B pada tahun 2012 melalui Surat Keputusan 003/BAN-PT/Ak-SURV-II/S3/V/2012 tertanggal 2 Mei 2012. Penilaian ini berlaku sampai dengan tanggal 10 Februari 2017. Selanjutnya pada tahun 2017, Badan Akreditasi Nasional Pendidikan Tinggi memberikan penilaian Akreditasi B melalui Surat Keputusan 3806/SK/BAN-PT/Akred/D/X/2017 tertanggal 17 Oktober 2017. Ketentuan penilaian ini berlaku sampai dengan tanggal 4 Juli 2022. Kemudian melakukan re-akreditasi melalui LAMEMBA dengan memperoleh hasil ‘Baik Sekali’. Akreditasi ini berlaku sejak 19 September 2022 sampai dengan 19 September 2027 berdasarkan Keputusan LAMEMBA No. 004/DE/A.5/AR.10/IX/2022.